El personal de recerca del CIBEK estarà constituït por metges de l'Hospital Clínic, professors de la Facultat de Medicina, investigadors del Consejo Superior de Investigaciones Científicas i investigadors del propi IDIBAPS (contractats a través de programes específics o de programes de reincorporació d'investigadors com el Ramón y Cajal o l'ICREA).
Existirà una convocatòria interna entre investigadors de l'IDIBAPS i, posteriorment, una convocatòria externa nacional i internacional per la selecció d'investigadors del CIBEK. L'Hospital Clínic i l'IDIBAPS atorguen al CIBEK un caràcter singular dins la seva estructura de recerca creant una Direcció específica pel centre.
L'edifici del CIBEK, actualment en fase de projecte, es convertirà en una nova icona de la Barcelona Biomèdica. La seva façana transmetrà modernitat i vitalitat. L'estructura interna permetrà una adaptació constant a les canviants prioritats de la recerca biomèdica. La distribució dels laboratoris serà oberta, per facilitar la comunicació entre grups. El centre estarà connectat amb l'Hospital Clínic per un pas subterrani a través del carrer Villarroel. Les estructures de Recerca de l'IDIBAPS (Facultat de Medicina, Hospital Cliníc i CIBEK) estaran, per tant, físicament interconnectades.
L'edifici es construirà sobre una parcel·la de 3.000 m2 situat al carrer Rosselló (entre els carrers Urgell i Villarroel). Tindrà una façana de 41 metres i una profunditat edificable de 25 metres. Els 2.000 m2 no edificats seran cedits a l'Ajuntament de Barcelona pel seu ús públic i es destinarà a parc urbà. Disposarà de planta baixa, una planta altell i cinc plantes amb una superfície total de 6.500 m2 sobre el nivell del terra. Tindrà de la mateixa manera una planta al subsòl de 2.560 m2 i dues plantes subterrànies també de 2.560 m2.
La planta baixa i la planta altell es dedicarà a espais comuns (cafeteria, sala d'actes, seguretat, porteria, recepció, direcció del CIBEK, IDIBAPS i Fundació Clínic, estructures administratives de recolzament als investigadors, recepció de visitants, vestuari, seminaris…). La planta del subsòl i les cinc plantes es destinaran a laboratoris d'investigació, laboratoris d'innovació tecnològica i a plataformes de recolzament a la investigació (genòmica, trancriptòmica, proteòmica, bioinformàtica, citometria, criopresevació). Els soterranis 1 i 2 es dedicaran a zones d'emmagatzematge i aparcament de vehicles.